質(zhì)譜法基因分型技術(shù)簡介
DNA質(zhì)譜陣列基因分析系統(tǒng)以其通量高、自動化、靈活、結(jié)果準確、實驗成本低廉等諸多優(yōu)勢成為了大學、醫(yī)學生物學研究所、生物技術(shù)公司、制藥企業(yè)、疾控中心等機構(gòu)所推崇的研究工具。應用領(lǐng)域涵蓋醫(yī)學及轉(zhuǎn)化醫(yī)學、分子生物學、基因組學、表觀遺傳學、農(nóng)業(yè)遺傳育種及轉(zhuǎn)基因技術(shù)等相關(guān)領(lǐng)域。
檢測儀器信息
Sequenom MassArray時間飛行質(zhì)譜生物芯片系統(tǒng)是為基因組學研究提供兼顧靈敏度和特異服務(wù)的中高通量技術(shù)平臺,廣泛地應用于遺傳突變檢測、SNP分型以及DNA甲基化定量分析研究,是目前唯yi采用質(zhì)譜法進行直接檢測的設(shè)備。
Sequenom MassArray系統(tǒng)反應體系為非雜交依賴性,不需要各種標記物,實驗設(shè)計靈活,更可實現(xiàn)高達40重反應,是目前市場上擁有高性價比的產(chǎn)品。
Sequenom MassArray特定SNP位點檢測服務(wù)采用專業(yè)的引物設(shè)計和基因分型軟件,可對95%以上已被證實的SNP進行實驗設(shè)計,特別適合于SNP位點小于200個,樣本量大于500份的項目。實驗過程無需熒光標記,大大降低每次基因型分析的成本。
檢測原理
Sequenom MassARRAY® 分子量陣列技術(shù)是Sequenom 公司推出的世界上的基因分析工具,通過引物延伸或切割反應與靈敏、可靠的MALDI-TOF質(zhì)譜技術(shù)相結(jié)合,經(jīng)過PCR擴增,SAP酶處理, 延伸引物單堿基延伸,樹脂除鹽純化, 芯片點樣, 質(zhì)譜檢測等實驗步驟,終使用Typer4.0 軟件分析實驗數(shù)據(jù),獲得基因分型結(jié)果。
具體原理:Sequenom MassArray系統(tǒng)主要是利用基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜 (MALDI-TOF MS) 進行分析,即PCR擴增產(chǎn)物或者預處理樣本在延伸單堿基后,將制備的樣品分析物與芯片基質(zhì)共結(jié)晶,將該晶體放入質(zhì)譜儀的真空管,而后用瞬時納秒 (10-9s) 強激光激發(fā),由于基質(zhì)分子經(jīng)輻射所吸收的能量,導致能量蓄積并迅速產(chǎn)熱,從而使基質(zhì)晶體升華,核酸分子就會解吸附并轉(zhuǎn)變?yōu)閬喎€(wěn)態(tài)離子,產(chǎn)生的離子多為單電荷離子,這些單電荷 離子在加速電場中獲得相同的動能,進而在一非電場漂移區(qū)內(nèi)按照其質(zhì)荷比率得以分離,在真空小管中飛行到達檢測器。
檢測應用
中高通量SNP基因型分析
GWAS及二代測序驗證
腫瘤體細胞基因突變譜分析
基因表達定量及目標基因CNV分析
DNA甲基化定位定量
病原體分子分型
技術(shù)優(yōu)勢
定制靈活:可以自由選擇感興趣的SNP位點一張芯片上,樣本的數(shù)量和位置可以自由選擇一張芯片上,樣本和SNP位點的配對可以自由選擇。
分析準確:直接檢測待測物分子量,準確度超過99.7%。質(zhì)譜技術(shù)靈活檢測PCR實驗失敗或三等位基因的存在??芍貜托愿撸總€樣品將要檢測到SNP位點適合精細定位和芯片實驗的后續(xù)研究。
高通量檢測:一張芯片上可完成384個樣品的多重iPLEX GOLD實驗;每個反應孔高可實現(xiàn)多達40重反應;每天可進行高達十萬次基因型分析。
檢測服務(wù)流程
1、客戶提供DNA或者生物樣本,并需要檢測SNP位點(rs編號)
2、設(shè)計引物(包括PCR擴增引物和單堿基延伸引物)
3、樣本制備PCR擴增、SAP處理、單堿基延伸
4、點樣制備檢測用芯片陣列
5、MALDI-TOF質(zhì)譜檢測
6、數(shù)據(jù)分析、給出分型報告
樣本要求
基因組DNA: 總量大于10 ng(視檢測位點數(shù)量遞增)
A260/280在1.8-2.0
A260/230大于1.8
服務(wù)流程
1、提交項目課題相關(guān)需求和資料。
2、與我們的專業(yè)技術(shù)團隊討論項目細節(jié)。
3、根據(jù)討論后的意見對實驗方案進行修改。
4、雙方均滿意并達成一致,簽訂技術(shù)服務(wù)合同。
5、開展實驗,按期完成合同規(guī)定的內(nèi)容。
6、結(jié)題,提供實驗原始結(jié)果和分析結(jié)果、實驗流程、實驗條件等等。
咨詢與訂購
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